Ricerca su metodologie computazionali di informatica nel settore biomedico
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Data
2010-01-01
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Abstract
Nel corso degli ultimi anni c’è stato un esplosivo aumento nella capacità di
acquisizione dei dati sperimentali associato ad un parallelo abbassamento
esponenziale nel costo.
Grazie a queste precondizioni tecnologiche ed economiche, è ora possibile
considerare progetti di ricerca biomedica che, all’interno di necessari vincoli di
privacy e bioetica, si pongano alla confluenza di questi due flussi di dati e che
abbiano come obiettivo studi ad alta risoluzione su coorti dell’ordine della
decina di migliaia di individui. Studi cioè che, a tecnologia corrente, possono
produrre ciascuno dataset dell'ordine della decina di petabyte, ed in cui la
quantità di informazione da analizzare e gestire è destinata a crescere di un
ordine di grandezza almeno ad ogni successiva (in tecnologia) campagna di
acquisizione sperimentale sugli stessi campioni biologici.
Lo scopo di COBIK è di costruire una piattaforma software, una biobanca
computazionale, in grado di gestire in maniera uniforme ed efficiente tutto il
flusso informatico/computazionale necessario a condurre studi a grande scala
basati sull’integrazione sistematica di dati clinici e sperimentali, in particolare
nel contesto della genomica.
The COBIK project deals with problems stemming from the recent huge increase in dataset size from biosciences and health informatics. Its main goal is building a software framework capable of efficiently and uniformly handling the computational throughput associated to large-scale studies based on the integration of clinical and experimental data, specifically in the field of genomics.
The COBIK project deals with problems stemming from the recent huge increase in dataset size from biosciences and health informatics. Its main goal is building a software framework capable of efficiently and uniformly handling the computational throughput associated to large-scale studies based on the integration of clinical and experimental data, specifically in the field of genomics.
Descrizione
Keywords
flussi di dati , biobanca computazionale , data set