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Ricerca su metodologie computazionali di informatica nel settore biomedico
(2010-01-01) Zanetti, Gianluigi; CRS4-Italy-coordinator
Nel corso degli ultimi anni c’è stato un esplosivo aumento nella capacità di acquisizione dei dati sperimentali associato ad un parallelo abbassamento esponenziale nel costo. Grazie a queste precondizioni tecnologiche ed economiche, è ora possibile considerare progetti di ricerca biomedica che, all’interno di necessari vincoli di privacy e bioetica, si pongano alla confluenza di questi due flussi di dati e che abbiano come obiettivo studi ad alta risoluzione su coorti dell’ordine della decina di migliaia di individui. Studi cioè che, a tecnologia corrente, possono produrre ciascuno dataset dell'ordine della decina di petabyte, ed in cui la quantità di informazione da analizzare e gestire è destinata a crescere di un ordine di grandezza almeno ad ogni successiva (in tecnologia) campagna di acquisizione sperimentale sugli stessi campioni biologici. Lo scopo di COBIK è di costruire una piattaforma software, una biobanca computazionale, in grado di gestire in maniera uniforme ed efficiente tutto il flusso informatico/computazionale necessario a condurre studi a grande scala basati sull’integrazione sistematica di dati clinici e sperimentali, in particolare nel contesto della genomica.